La gare de Busrt a été inaugurée en même temps que la ligne 89, le 14 décembre 1868. Près de dix ans plus tard, le 1er juin 1876, la liaison avec Alost (ligne 82) a été mise en service. À cette époque, la gare était équipée d’un bâtiment en briques construit selon les normes classiques, à savoir composé de trois parties: la partie centrale avec un étage et deux ailes latérales symétriques. Un hangar aux marchandises avec un toit plat équipait également la station avec, attenant, un bâtiment réservé aux toilettes.

La gare disposait de trois voies à quai ainsi que d’une voie de garage et d’une voie en cul-de-sac. Ces deux dernières étaient utilisées pour le chargement et le déchargement des marchandises. De l’autre côté du passage à niveau, du côté de Zottegem, se trouvait le seul poste d’aiguillage de type Saxby avec, en face, la maison du garde-barrière. La situation est restée inchangée pendant plusieurs décennies. Ce n’est qu’à l’approche de l’électrification des lignes de chemin de fer qu’il a été décidé de remplacer l’ancienne gare par une nouvelle construction. L’ancienne infrastructure a été démolie et la nouvelle gare a été mise en service en 1984. Le bâtiment moderne, sobre et rectangulaire, abritait initialement les guichets, la salle d’attente et quelques locaux de service. En 1991, le hangar aux marchandises a été fermé et remplacé par un commerce de matériaux de construction. Le parking de la gare a été allongé dans le prolongement de la gare.